Stan: 丸めた値をあつかう
整数などに丸めた値から、元の値を推定するStanのモデルです。R Notebook形式ですが、Stanのコードは6.1 Bayesian Measurement Error Modelにあるコード..
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共通の分母で割り算して対数を取った値同士の相関
生態学にありがちな、共通の変数で割り算して対数を取った変数同士の相関（log(葉面積あたりの○○)とlog(葉面積あたりの××)とか）を考えてみました。対数値としては、共通の変数をひいてやったこと..
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Stan: 階層距離標本抽出モデル
Kéry and Royle (2016) “Applied Hierarchical Modeling in Ecology”の8.5.2節、階層距離標本抽出モデルのうち、距離がビンに分割されて..
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Stan:「クネクネ」した関係をガウス過程で推定する
Kéry and Royle (2016)の10.14節にある「クネクネ」した(wiggly)関係の推定をStanをつかってガウス過程でやってみました。元ネタでは、在/不在データをさらに検出/不検..
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ポアソン分布のデータに負の二項分布をあてはめてみるテスト
ポアソン分布のデータに負の二項分布をむりやりあてはめてみたテストです。
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Stan: 悪い例2題
Stanで（に限らず）うまく推定できない、というより、モデルがまちがっているという例です。
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Stan: 欠測値のある隠れマルコフモデル
欠測値のある隠れマルコフモデルのコードをStanでかいてみました。
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Stan: はずれ値をあつかう
『ベイズモデリングの世界』講義3の はずれ値のモデルをStanでやってみました。
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『時系列分析と状態空間モデルの基礎』
時系列分析と状態空間モデルの基礎—RとStanで学ぶ理論と実装— 馬場真哉, プレアデス出版, 2018 MARUZEN&ジュンク堂書店札幌店にて購入。
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Stan: ガウス過程をためしてみたメモ(2)
こんどは、2次元の入力に対するクラス分類をためしてみました。
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Stan: ガウス過程をためしてみたメモ
Stanでガウス過程をためしてみたメモです。 だいたいStan Modeling Language User’s Guide and Reference Manualの18章を参考にしま..
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ゼロがなくなったポアソン分布のパラメーターを切断ポアソン分布で推定する
先日のモデルですが、Stanでは切断ポアソン分布をつかえるので、それをつかえばよいのでした。
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