状態空間モデルをためす(2)
状態空間モデルその2。2項分布の仮想データをつかう。
タグ： R MCMC jags

状態空間モデルをためす
状態空間モデルの勉強。やはり自分でコードを書いてみないと。 まずはPetris and Petrone (2011)にあった例から。 data(Nile) ## dlm ..
タグ： MCMC R jags dlm

JAGSがMacPorts入り
JAGS News » Blog Archive » JAGS on MacPorts MacPortsでもインストールできるようになったとのこと。 sudo..
タグ： jags MCMC

JAGSはどのくらい速いか
JAGS News » Blog Archive » How fast is JAGS? JAGS Newsに、OpenBUGSとの速度比較の記事。モデルによって速..
タグ： jags MCMC

R: runjags
runjags: Run Bayesian MCMC Models in the BUGS syntax from Within R JAGSを呼び出すパッケージ。収束状況をみて自動的に繰り返し..
タグ： MCMC jags R

R: glmmBUGS
Brown P, Zhou L (2010) MCMC for Generalized Linear Mixed Models with glmmBUGS. R Journal 2(1): 13&n..
タグ： R MCMC glmm

RGRのベイズモデリング
承前。ちょっとやってみた。 xは共変量でβは係数。εとεwは誤差。εが変動性による誤差、εwが測定誤..
タグ： R MCMC

snowで並列化してJAGSを実行する関数
自作のJAGS実行R関数をsnow対応にしてみた。例によってエラーチェックとかはいいかげん。あと、JAGS 2対応は不十分。
タグ： MCMC jags R

JAGSをsnowで並列化
syou6162さんのところの解説を参考にして、snowパッケージをつかってJAGSを並列化してみた。これはいいかも。
タグ： rjags MCMC jags R

MCMC: tauの事前分布
Carlin & Louis "Bayesian Methods for Data Analysis (3rd ed.)"の45ページ以降で、分散の逆数tauにあたえる事前分布が論..
タグ： MCMC

OpenBUGS 3.0.8
OpenBUGSのサイトが移転していて、3.0.8がリリースされていた。BRugsとR2WinBUGSはもうすぐ利用可能になるとのこと。 Mac OS X 10.6上では、Wine 1.0.1で..
タグ： MCMC OpenBUGS

MAGROの推定結果を検証する
MAGROの推定結果を他のソフトによるものと比較してみる。
タグ： MCMC MAGRO