JAGSをGCD対応にできるか
JAGS 2.0.0をGrand Central Dispatch対応にできないかとちょっとやってみたが。
タグ： jags Grand Central Dispatch

Mac OS XでJAGS 2.0.0のビルド
Mac用のバイナリも公開されたが、なんか自前ビルドの方が速いみたい。前回は"-O3"をつけたが、これはよくないとインストールマニュアルにあった。で、今回はこういうふうに。 C..
タグ： jags

JAGS 2.0.0 リリース
JAGS News » JAGS 2.0.0 is released ということで、JAGS 2.0.0がでました。glmモジュールでは、センタリングを自動でやってくれるようだ。
タグ： jags

JAGSのconfigure
MAGRO: 実行時間の比較でJAGSの成績が異様に悪く、ところが研究室マシンのJAGSは速かったので、自前でJAGSをコンパイルしなおしてみた。結果として、configureを見直すことで改善される..
タグ： jags MCMC

Rからjagsを呼び出す関数(2)
Rからjagsを呼び出す関数のつづき。複数の鎖に対応させた。 とはいえ、あいかわらずエラー処理は適当だし、決め打ちのところもいろいろある。
タグ： jags R

いちおう時系列なデータのMCMC
こういうデータのパラメータをMCMCでベイズ推定してみる。 結果のグラフ
タグ： R MCMC jags

JAGS 1.0.4リリースと2.0情報
JAGS News » Blog Archive » JAGS 1.0.4 JAGS 1.0.4リリース。セキュリティフィックスとなる。 JAGS 2.0も ..
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JAGSの出力ファイル名にランダムなプレフィクスをつける
農林水産研究情報総合センターの並列計算システムでJAGSを使うのに便利なように、JAGSの出力ファイル名にランダムなプレフィクスをつけるパッチを書いてみた。もっとも、かなりテキトーである。
タグ： jags

ランダムエフェクトつき比例ハザードモデルのMCMC推定
ランダムエフェクトのある比例ハザードモデルのMCMC推定。bugs-examplesのleukを参考に。 survivalパッケージのratsデータを使用。 > library(surv..
タグ： jags MCMC

JAGS Installer@Snow Leopard
JAGS 1.0.3のSnow Leopard対応インストーラーが公開されております(JAGS News: Updated installer for Mac Os X)。
タグ： jags

64bit JAGS
64bitなJAGSをビルドしてみた。 F77=/opt/bin64/ifort CXXFLAGS="-O3 -arch x86_64" ./configure --with-blas="-lm..
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JAGSとWinBUGSとの違い
JAGS用に書いたBUGSのコードをWinBUGSに適用してみたが、そのままではうまくいかず。気がついたのは以下の2点。 確率分布関数(dnormやdgammaなど)の引数に与えることができるの..
タグ： jags winbugs